【摘 要】
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目的：浙江省、福建省和上海市东南沿海地区汉坦病毒(Hantanvirus,HV)的基因比较.方法：收集浙江省、福建省和上海市HV部分M基因序列,应用MEGA4.0和DNA STAR软件包进行系统发生分析,以邻位相连法(NJ)构建系统发生树,分析东南沿海地区浙闵沪二省一市HV的基因差异,分析采用1000个多序列组.结果：经对浙闵沪二省一市若干株HV基因的序列比较与系统进化分析,本省市分离的同型别毒株
【机 构】
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浙江省疾病预防控制中心,浙江省肾综合征出血热疫苗研究重点实验室,杭州310051 南京医科大学第一
【出 处】
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第六届传染病防控技术研究与应用技术论坛
论文部分内容阅读
目的：浙江省、福建省和上海市东南沿海地区汉坦病毒(Hantanvirus,HV)的基因比较.
方法：收集浙江省、福建省和上海市HV部分M基因序列,应用MEGA4.0和DNA STAR软件包进行系统发生分析,以邻位相连法(NJ)构建系统发生树,分析东南沿海地区浙闵沪二省一市HV的基因差异,分析采用1000个多序列组.
结果：经对浙闵沪二省一市若干株HV基因的序列比较与系统进化分析,本省市分离的同型别毒株的基因序列同源性高于不同省市分离毒株,而本省市的同地区分离株的核苷酸同源性更高,地区接近的分离株系统进化分支的分布也大部分更靠近.汉滩型病毒(Hantaan virus,HTNV)福建株的ZH53和汉城型病毒(Seoul virus,SEOV)浙江建德株Gou3和ZJ5与本研究同型别的其他株及国际标准株的核苷酸同源性较低,分别为82.7％-86.3％和84.0％-85.3％,而且分别在HTNV和SEOV发生群中构成一独立分支.浙江省从田鼠中分离到SEO型病毒,产生宿主“溢出”的现象.
结论：浙闵沪东南沿海地区HV的基因差异和亲缘远近关系主要表现在地区性,显示出高度的地理聚集现象,浙江建德地区和福建分别存在着SOEV和HTNV的特殊亚型病毒.
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