【摘 要】
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目的:采用生物信息学方法对肝癌和2型糖尿病的共同差异表达基因进行分析,以揭示肝癌与2型糖尿病之间的潜在病理生理联系.方法:从公共数据库(GEO)下载肝癌与2型糖尿病的基因表达阵列数据,通过R软件对数据进行预处理,获得重叠差异表达基因,进一步利用DAVID和STRING数据库对这些差异基因进行基因富集分析并构建蛋白互作网络.使用在线数据库GEPIA进行生存分析.结果:通过差异基因筛选,我们获得328个重叠差异基因,包括176个共同差异基因以及152个独立差异基因.共同差异基因包括78个上调基因,98个下调基
【机 构】
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武汉大学中南医院消化内科/湖北省肠病临床研究中心/肠病湖北省重点实验室 湖北武汉430071
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目的:采用生物信息学方法对肝癌和2型糖尿病的共同差异表达基因进行分析,以揭示肝癌与2型糖尿病之间的潜在病理生理联系.方法:从公共数据库(GEO)下载肝癌与2型糖尿病的基因表达阵列数据,通过R软件对数据进行预处理,获得重叠差异表达基因,进一步利用DAVID和STRING数据库对这些差异基因进行基因富集分析并构建蛋白互作网络.使用在线数据库GEPIA进行生存分析.结果:通过差异基因筛选,我们获得328个重叠差异基因,包括176个共同差异基因以及152个独立差异基因.共同差异基因包括78个上调基因,98个下调基因,独立差异基因包含在糖尿病中下调的82个基因以及在肝癌中下调的70个基因.通过基因富集分析发现,共同差异基因主要富集在DNA损伤以及免疫调控、细胞凋亡等功能,独立差异基因的功能主要富集在有机氮化合物代谢,最后通过以共同差异基因为目标构建蛋白互作网络,获得核心节点蛋白.对核心节点蛋白进行生存分析,得到6个生存相关核心基因.结论:本研究通过生物信息学方法筛选同时与肝癌和2型糖尿病相关的8个核心基因,为研究糖尿病相关肝癌提供靶点参考.
其他文献
目的:探究沙棘多糖对地塞米松诱导脂质代谢紊乱指标的作用,同时探究其对相关基因脂联素(Adiponectin)和低密度脂蛋白受体(LDLR)表达的影响.方法:选取健康成年雄大鼠35只,随机分对照组、模型组、低剂量组、中剂量组和高剂量组.通过腹腔注射地塞米松构建脂质代谢紊乱模型组;分别给低剂量组、中剂量组、高剂量组小鼠以沙棘多糖50、100、200 mg/kg的剂量灌胃,其余各组同体积生理盐水灌胃,灌胃持续4周.然后取大鼠血清检测总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、血清游离脂肪酸(FFAs)、葡萄糖和Adip
目的 探讨纽曼系统护理模式对胃癌患者负性情绪及生存质量的影响.方法 选取2018年1月-2020年6月收治的胃癌患者60例,根据随机数字表分为实验组(30例)与对照组(30例),对照组患者施行常规性护理干预,实验组患者施行纽曼系统护理模式,比较两组患者护理前后负性情绪[抑郁自评量表(SDS)、焦虑自评量表(SAS)]与生活质量[健康相关生存质量量表(HRQOL)评分].结果 护理前两组患者负性情绪、生活质量评分比较(P＞0.05),护理后,两组患者SDS、SAS评分均明显降低,且研究组患者评分更低(P＜0
目的:研究重症新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者的独立预后影响因素,并构建与此相关的预测模型.方法:按照COVID-19和呼吸衰竭诊断标准筛选研究对象,通过病史、临床表现、实验室检查、影像学检查和临床预后等指标筛选影响预后的独立因素,并构建预测短期预后的列线图模型.结果:共收集武汉雷神山医院和武汉市第七医院重症COVID-19并发呼吸衰竭患者72名,经过Cox多因素回归分析得出独立风险因素包括年龄[校正风险比(aHR:1.052;95％CI:1.002～1.105]、氨基末端脑钠肽前体(aHR:1.
目的:探讨化学发光微粒子免疫法对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)总抗体及IgM抗体的检测效果及两种抗体的产生规律.方法:选取武汉大学中南医院收治的197例确诊新型冠状病毒肺炎患者,其中包含了24例核酸检测阴性但通过临床症状和CT检测确诊的患者;已排除新型冠状病毒感染的其他就诊患者142例作为对照组,通过化学发光法对这些患者的总抗体及IgM抗体进行检测.收集所有确诊患者不同发病时间的抗体检测样本(血清或血浆)242份、核酸检测样本853份,对不同发病时间的样本检测结果进行统计分析.结果:SARS-CoV
目的:分析25例达出院标准的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)复检新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸阳性(简称复阳)患者的临床表现、实验室指标.方法:回顾性分析2020年1-4月在湖北医药学院附属东风医院收治的25例复阳患者不同时间点临床资料.结果:淋巴细胞(LYM)在各时期均有明显差异(均P＜0.05);与确诊时比,复阳和出院时超敏C反应蛋白(hs-CRP)明显降低(均P＜0.05),复阳时Ct值、白细胞(WBC)明显升高(均为P＜0.05),中性粒细胞比值、淋巴细胞比值、降钙素原在各时间点均无
目的 将膳食护理联合营养管理模式应用于老年肺癌胸腔镜手术患者,观察该方法对机体营养状态的影响.方法 选取2018年5月-2020年5月进行胸腔镜手术的老年肺癌患者70例作为护理的对照实验对象,按随机数字表法将其分为对照组(n=35)和研究组(n=35).两组患者均行腹腔镜下肺癌根治术,对照组给予常规术后护理,在此基础上研究组给予膳食护理联合营养管理模式.对比两组出院前1d、出院后3个月的前白蛋白(PA)、血红蛋白(Hb)、转铁蛋白(TF)及白蛋白(Alb)水平;对比两组术后切口愈合情况.结果 出院前1d、
目的:研究长春胺对非动脉炎性前部缺血性视神经病变(NAION)大鼠模型的潜在神经保护作用.方法:90只SD大鼠随机分为正常组、单纯模型组、造模羧甲基纤维素钠灌胃组(NaCMC)组、长春胺组、造模PI3K抑制剂LY294002玻璃体腔注射(IVT LY)+长春胺组、造模DMSO玻璃体腔注射(IVT DMSO)+长春胺组.对各组进行眼底照相,眼底荧光血管造影,血清一氧化氮(N0)浓度检测,HE染色观察视网膜形态,甲苯胺蓝染色观察视神经轴突形态,免疫荧光染色计数视网膜神经节细胞(RGCs),实时定量PCR检测p
目的:探究不同梗死时间的脑卒中大鼠腓肠肌(GM)超声弹性特征表现、肌肉脂肪改变,及两者之间的关系.方法:SD雄性大鼠跟据大脑中动脉栓塞(MCAO)造模的方式和术后时间,分为假手术组(n=6)、脑梗死1.5h组(n=7)和脑梗死2h组(n=6).各组大鼠在不同时间点完成体质量测量、改良神经功能缺损评估(MNSS)、背地性测试(negative geotaxis test),术后1月完成超声弹性成像评估GM硬度,取材后进行油红O测试.结果:超声结果显示,梗死2h组偏瘫侧GM的Young\'s模量均大于1.
目的:通过生物信息学分析鉴定喉鳞状细胞癌(LSCC)的潜在诊断、预后基因.方法:高通量基因表达数据库(GEO)中的数据(GSE143224和GSE59102)和癌症基因组图谱(TCGA)中的转录组数据用于生物信息学分析.确定了癌与正常样本之间的差异表达基因(DEGs),并进行了功能和通路的富集分析.此外,使用Cox比例风险模型确定了与LSCC的发病机制和预后有关的基因.诺模图对患者的生存结局进行了量化.结果:总共确定了117个上调的DEGs和250个下调的DEGs.细胞外泌体和代谢途径是主要的生物学过程.
目的:评价手术对晚期弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者生存的影响.方法:分析在美国监测、流行病和最终结果(SEER)注册中心登记的2004年1月至2016年12月的病理学确诊的Ⅲ/Ⅳ期的DLBCL患者.根据是否行手术治疗将患者分为手术组和对照组,采用卡方检验比较两组间临床基线特征,1∶2倾向性评分匹配(PSM)用于平衡组间混杂因素干扰,并采用Kaplan-Meier曲线及Cox生存分析评价影响患者总生存(OS)及肿瘤特异性生存(cSS)的因素.结果:本研究共纳入20918名晚期DLBCL患者,其中接受