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1985年以前对基因中显著的缺失、插入、重排,可以用Southern杂交法来鉴定。一些小的变异,包括单碱基改变,只有当它们位于限制性内切酶的切点上时,方可被检出(如RFLP,限制性片段长度多态性)。如果这些小的变异不是位于限制性内切酶的切点上,那么只有对整个的基因进行顺序测定,当然,这是费时费力的。检测基因中的未知突变较为有效的方法于1985年