基于GEO数据库对儿童哮喘急性发作靶基因的生物信息学分析

来源 :生命科学研究 | 被引量 : 0次 | 上传用户：heimacom

【摘要】

：

为了通过生物信息学技术筛选并分析关键基因以探究儿童哮喘急性发作的病理机制,从GEO数据库下载儿童哮喘急性发作相关基因芯片数据集(GSE103166),用R软件包工具筛选出哮喘急

【作者】

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张迪姜凡刘璐佳景伟超王有鹏

【机构】

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黑龙江中医药大学第二临床医学院,黑龙江中医药大学附属第二医院

【出处】

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生命科学研究

【发表日期】

：

2021年1期

【关键词】

：

儿童哮喘生物信息学差异表达基因(DEGs) 关键基因分子生物学机制 childhood asthma bioinformatics differentia

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目(81874485),黑龙江省自然科学基金资助项目(LH2020H088),黑龙江省中医药管理局项目(ZHY2020-149),黑龙江中医药大学科研基金项目(2018bs01),黑龙江省名中医专家传承工作室项目

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为了通过生物信息学技术筛选并分析关键基因以探究儿童哮喘急性发作的病理机制,从GEO数据库下载儿童哮喘急性发作相关基因芯片数据集(GSE103166),用R软件包工具筛选出哮喘急性发作患儿与健康儿童的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),用DAVID (version 6.8)在线工具获取DEGs列表的GO和KEGG注释结果,同时通过STRING (version 11.0)获取其蛋白质互作数据,应用Cytoscape及其插件MCODE构建蛋白质互作网络、

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