人肿瘤增殖细胞核抗原HLA-Ⅰ类分子限制性细胞毒性T淋巴细胞表位的多参数预测

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目的 预测人增殖细胞核抗原(PCNA)的HLA-Ⅰ类分子限制性细胞毒T淋巴细胞(CTL)表位.方法 使用基于矩阵法预测表位的BIMAS和SYFPEITHI数据库,以及基于蛋白体酶切割位点预测表位的PAProC数据库,对人肿瘤PCNA抗原的CTL表位综合评分.结果 得到针对HLA-A0201的位于PCNA氨基酸序列228~236(SMSADVPLV,分值为447 633.595)和22~30(LINEACWDI,分值为127 966.779)位置的两个可能表位;针对HLA-A24的位于113~121(DYEMKLMDL,分值为563 994.9)和143.151(EFARICRDL,分值为40540.7)的两个可能表位;针对HLA-A1101的位于72~80(LTSMSKILK,分值为1334.2680)和232~240(DVPLVVEYK,分值为736.9236)的两个可能表位.结论 实验提供了肿瘤抗原表位的多参数预测方法,为应用PCNA肽表位制备肿瘤疫苗奠定了基础。

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