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目的
筛选与结直肠癌细胞放疗敏感性相关的长链非编码RNA (lncRNA)。
方法将HT29、SW480、RKO、Lovo和HCT116等5株结直肠癌细胞梯度照光后行克隆形成实验,通过细胞存活率(SF2值)来检测5株细胞的放疗敏感性差异;利用高通量lncRNA芯片筛选在SW480、RKO和Lovo细胞株中两两比较表达差异均大于2倍的lncRNA,并通过实时定量PCR进一步检测所选lncRNA在5株结直肠癌细胞中的表达差异。
结果5株结直肠癌细胞放疗敏感性由低至高(即SF2值由高至低)依次为HT29 (0.83±0.03)、SW480 (0.69±0.02)、RKO (0.53±0.02)、Lovo (0.47±0.05)和HCT116(0.32±0.03)(P<0.01)。lncRNA芯片筛选得到5种与结直肠癌细胞放疗敏感性相关的lncRNA基因,其中R05532、NR_015441和NR_033374基因表达水平与细胞放疗抵抗呈正相关(均P<0.01),而NR_073156和AA745020基因表达水平与细胞放疗抵抗无明显相关性(均P>0.05)。
结论R05532、NR_015441和NR_033374三种lncRNA可能成为结直肠癌细胞放疗敏感性的预测分子,其高表达提示放疗抵抗。