【摘 要】
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目的应用基因测序分析进行诺卡菌(Nocardia farcinica)鉴定。方法将临床分离菌株BJ7菌株与诺卡菌标准参照菌株AY756551和结核分枝杆菌H37Rv接种L-J、PNB/TCH鉴别培养基。用生
【机 构】
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中国疾病预防控制中心传染病预防控制所／传染病预防控制国家重点实验室,扬州大学,北京市朝阳区疾病预防控制中心结核病防治所
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(No.30800029);国家“十一五”重大传染病防治科技重大专项“结核病传播模式研究”(2008ZX100/03-010-02)联合资助
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目的应用基因测序分析进行诺卡菌(Nocardia farcinica)鉴定。方法将临床分离菌株BJ7菌株与诺卡菌标准参照菌株AY756551和结核分枝杆菌H37Rv接种L-J、PNB/TCH鉴别培养基。用生长良好的培养物提取全基因组DNA。设计引物,对rpoB、16S rDNA基因片段进行PCR扩增,对其PCR产物进行测序和网上同源性比对。结果 PNB/TCH鉴别培养基鉴定BJ7为非结核分枝杆菌,进化树中BJ7 16S rDNA序列亲缘关系与诺卡菌标准参照菌株AY756551比较相近,且16S rDNA和rpoBDNA序列与马鼻疽诺卡菌同源性极高,分别达到100%和99%。结论从结核病患者分离的菌株BJ7为马鼻疽诺卡菌。DNA测序分析能够快速、简便、准确地鉴定诺卡菌。
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