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光动力治疗仪是利用光动力疗法进行癌症治疗的一种新型医疗仪器。为了解决光动力治疗仪照射光色纯度不高的问题，引入光子晶体理论，采用传输矩阵法进行MATLAB编程分析光子晶体禁带特性，甄选合适的光子晶体材料，确定其结构参量。结果表明，所设计的新型光子晶体掺杂结构，对一定频率范围内的入射光，只允许对肝癌、胃癌等内脏器官癌症具有治疗效果的980 nm的近红外光通过，具有良好的滤波特性。利用此特性可以制作光子晶体滤波器，将此滤波器应用到普通光动力治疗仪上，对癌症的治疗起到很大的作用。