【摘 要】
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目的:通过生物信息学分析筛选与肝癌预后有关的miRNA及其调控的靶基因,为开发肝癌新的预后标志物及治疗策略提供新思路。方法:利用来自TCGA数据库中肝癌的miRNA表达数据、mRN
【机 构】
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内蒙古医科大学附属医院临床医学研究中心(自治区重点实验室),内蒙古大学生命科学院
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目的:通过生物信息学分析筛选与肝癌预后有关的miRNA及其调控的靶基因,为开发肝癌新的预后标志物及治疗策略提供新思路。方法:利用来自TCGA数据库中肝癌的miRNA表达数据、mRNA表达数据和临床预后数据,利用R软件中的limma包和survival包对miRNA进行差异表达分析和预后分析,利用多个数据库对具有预后意义的miRNA进行靶基因预测并降维得到高置信度的靶基因集,对所有靶基因进行GO、KEGG和蛋白进行互作网络分析;对筛选出来的枢纽基因在肝癌中的预后意义进行分析,并对其激酶靶点进行预测。结果:通
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