【摘 要】
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TRANSPARENT TESTA GLABRA1 (TTG1)基因编码具有WD40重复序列蛋白,对植物的毛状体形成发育起重要作用。本试验以‘贵农5号’刺梨为材料,基于果实转录组测序,采用RT-PCR的方法
【机 构】
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贵州大学农学院贵州省果树工程技术研究中心;
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(31660549);贵州省高层次创新型人才培养计划项目(黔科合人才20164016)共同资助
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TRANSPARENT TESTA GLABRA1 (TTG1)基因编码具有WD40重复序列蛋白,对植物的毛状体形成发育起重要作用。本试验以‘贵农5号’刺梨为材料,基于果实转录组测序,采用RT-PCR的方法获得刺梨TTG1基因的cDNA序列(命名为RroTTG1),并进行相关生物信息学预测分析。结果显示,RroTTG1基因的开放阅读框序列长度为1 041 bp,编码345个氨基酸。预测得到该蛋白含有典型的WD40-repeat保守结构域,具有较好的亲水性,但不是膜蛋白或分泌蛋白;含有45个磷酸化位点;二级结构有11.27%α-螺旋、33.53%的β-折叠、4.43%β-转角和50.87%无规卷曲;蛋白系统进化树分析表明该蛋白与蔷薇科的玫瑰、月季、草莓和覆盆子等的同源基因聚在一起,尤其与玫瑰(Rosa rugosa) TTG1亲缘关系最近。本研究为进一步探索RroTTG1基因在刺梨毛状体起始和发育中的功能提供了科学依据。
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