【摘 要】
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目的:探讨不同打分函数(Surflex_score, D_score, G_score, PMF_score, ChemScore)对计算机虚拟筛选乙酰胆碱酯酶(AchE)抑制剂的影响.方法:采用分子对接软件Surflex虚拟筛选4
【机 构】
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中国人民解放军第458医院神经内科,中山大学中山医学院解剖学教研室海洋微生物功能分子广东省高校重点实验室
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目的:探讨不同打分函数(Surflex_score, D_score, G_score, PMF_score, ChemScore)对计算机虚拟筛选乙酰胆碱酯酶(AchE)抑制剂的影响.方法:采用分子对接软件Surflex虚拟筛选40个AchE抑制剂和3 960个无活性分子,对筛选结果分别使用单个打分函数和多个打分函数组合后对得分排序,以富集率作为评价指标.结果:单独以ChemScore一个函数抽提对接后结合模式再行打分排序后富集率为27,将ChemScore和 G_score两个函数组合后排序也可获得27的富集率.结论:组合多种不同的打分函数也能获得不少于用单个打分函数打分所得的活性化合物,单独以ChemScore一个打分函数抽提对接后的结合模式再行打分排序,有更高的效率.
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