玉米大斑病菌 MAPK 超家族的全基因组鉴定及途径模型建立

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【目的】从全基因组水平鉴定玉米大斑病菌(Setosphaeriaturcica)的MAPK超家族基因,并对其进行系统进化、基因结构、多重序列比对及保守位点分析,构建玉米大斑病菌中的MAPK级联途径模型,为深入研究该植物病原菌中MAPK级联途径的功能奠定基础。【方法】利用玉米大斑病菌基因组数据库,通过基于隐马尔科夫模型的HMMER3.0软件搜索基因组,鉴定并获得MAPK超家族成员序列、基因组定位信息;采用MEGA5.0软件进行系统进化分析;通过GSDS工具进行基因结构分析;利用Clusta IX、MEME工
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