为进行沉水植物对罗氏沼虾养殖系统的水质调控效应研究，探讨了浮游植物、浮游动物、微生物优势种群与影响水质的环境因子之间的关系，对比传统养殖组与基于沉水植物原位净化的生态养殖组在水质、浮游动植物和微生物群落结构特征差异。结果表明：两组养殖水体水质与浮游生物群落结构均存在显著差异。生态养殖组的总磷（TP）、总氮（TN）、化学需氧量（COD）和叶绿素a（Chl-a）浓度均低于传统养殖组。传统养殖组浮游植物与浮游动物生物量均高于生态养殖组，两组浮游植物与浮游动物多样性指数存在显著差异。微生物主要包括放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门和变形菌门，其中生态养殖组放线菌门的丰度最高，传统养殖组优势菌为蓝细菌门的微囊藻属、鱼腥藻属等以及拟杆菌门的黄杆菌属等。冗余分析表明TP、COD和溶解氧（DO）是影响水体浮游生物群落组成与分布的关键因子。研究表明，利用沉水植物开展罗氏沼虾养殖水环境的原位净化，可显著消减养殖水体氮、磷营养盐，降低浮游动植物生物量，提高水体菌群落结构稳定性，改善养殖水环境。研究结果为沉水植物在罗氏沼虾养殖中的水质调控应用提供参考。