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科技计划管理改革后的五类计划之一国家重点研发计划的实施给高校带来了新的机遇与挑战,本文以南京农业大学为例,分析该校国家重点研发计划农林专项立项情况,并对申报和项目实施管理工作进行思考,提出了项目申报前期筹备工作和具体申报工作建议以及立项后推进一体化实施,逐步将项目管理转变为协同创新管理等建议。