海南短指软珊瑚全基因组测序初步分析

来源 :海南热带海洋学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wxy20009
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以Sinularia软珊瑚为研究对象,用Covaris超声波破碎仪随机将其DNA样品打断成长度为350 bp的片段,构建好的文库通过Illumina Nova Seq进行PE测序.结果表明:软珊瑚Sinularia ceramensis Verseveldt基因组大小为649. 58 Mbp,杂合率为1. 25%,重复序列比例为57. 06%.采用kmer=43进行初步组装,得到contig N50为836 bp,总长为586. 07 Mbp,scaffold N50为1 044 bp,总长为599. 1
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