植物病原细菌(Ralstonia solanacearum)基因组分泌信号肽计算机分析染色体

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应用SignalP3.0、TMHMM2.0、THUMBUP、big—PI、TargetP1.01、Lipop1.0、TatP1.0等7种软件对植物病原细菌Ralstonla solanacearumGMI1000染色体基因组3448个氨基酸序列进行预测分析。结果表明,该物种染色体基因组分泌信号肽ORFs有178个,占其基因组编码ORFs的5.2%,其中有150个ORFs属于I型分泌信号肽,28个ORFs属于Ⅱ型分泌信号肽。在178个ORFs中具RR—motif信号肽结构的有13个,其中11个属于I型信号肽
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