【摘 要】
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目的:采用孟德尔随机化法,以单核苷酸多态性(SNP)为工具变量,探究BMI与2型糖尿病(T2DM)的因果关系。方法:从IEU OpenGWAS project网站获得近3 a、样本量最大的BMI(ieu-b-40)及T2DM(ebi-a-GCST006867)的GWAS数据。从ieu-b-40中筛选与BMI高度相关的SNP(以P<5×10-8为筛选条件,连锁不平衡系数r~2为0.001,连锁不平衡
【机 构】
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潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学系
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(81803337,81872719); 山东省自然科学基金项目(ZR2019MH034);
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目的:采用孟德尔随机化法,以单核苷酸多态性(SNP)为工具变量,探究BMI与2型糖尿病(T2DM)的因果关系。方法:从IEU OpenGWAS project网站获得近3 a、样本量最大的BMI(ieu-b-40)及T2DM(ebi-a-GCST006867)的GWAS数据。从ieu-b-40中筛选与BMI高度相关的SNP(以P<5×10-8为筛选条件,连锁不平衡系数r~2为0.001,连锁不平衡区域宽度为10 000 kb)。从ebi-a-GCST006867中提取BMI有关的SNP(最小r~2>0.8,缺失的SNP用与其具有高度连锁性的SNP代替,删除无替代位点的SNP)。汇总上述两个数据集,剔除与T2DM直接相关的SNP,最终纳入包括rs8047395、rs13021737、rs663128等451个SNP作为工具变量。采用MR-Egger回归、加权中位数法(WME)、随机效应逆方差加权法(IVW)、加权模型4种回归模型分析BMI与T2DM的因果关系。结果:GWAS数据均来源于欧洲人群,男女不限。MR-Egger回归截距项为0.000 3(P=0.826 1),即筛选出的SNP不存在基因多效性。MR-Egger回归、WME、IVW、加权模型的OR(95%CI)分别为2.906(2.347~3.598)、2.938(2.676~3.226)、2.842(2.619~3.085)、2.980(2.440~3.638);由于存在异质性(Q=1 289.365,P<0.001),故关注随机效应IVW的结果。结论:BMI是T2DM的危险因素。
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