【摘 要】
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开发青藏扁蓿豆（Medicago archiducis-nicolai）单核苷酸多态性标记（single nucleotide polymorphism,SNP），并开展遗传多样性初步分析，为青藏扁蓿豆种质资源的评价与利用提供理论支持。以5个青藏扁蓿豆群体共80份材料进行GBS（genotyping-by-sequencing）测序，采用GATK软件开发SNP标记，并以此进行遗传结构和遗传多样性的
【机 构】
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中国科学院西北高原生物研究所中国科学院高原生物适应与进化重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（31770365）； 青海省创新平台建设项目（2021-ZJ-Y05）；
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开发青藏扁蓿豆（Medicago archiducis-nicolai）单核苷酸多态性标记（single nucleotide polymorphism,SNP），并开展遗传多样性初步分析，为青藏扁蓿豆种质资源的评价与利用提供理论支持。以5个青藏扁蓿豆群体共80份材料进行GBS（genotyping-by-sequencing）测序，采用GATK软件开发SNP标记，并以此进行遗传结构和遗传多样性的初步分析。测序产生的序列数据量为60.79 Gb，过滤后共获得12 796个SNP位点，且SNP突变类型存在明显的转换型偏差现象。不同地理来源青藏扁蓿豆群体观测杂合度（HO）为0.187 68-0.304 36，期望杂合度（HE）为0.201 97-0.364 34，遗传多样性指数（Pi）为0.178 32-0.241 34；祁连（QLCD）群体具有相对最高的遗传多样性水平。遗传结构分析表明5个群体分为2组，且群体遗传距离与地理距离之间存在极显著的正相关性。SNP标记适用于青藏扁蓿豆遗传多样性分析。
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