【摘 要】
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通过虚拟筛选分子对接技术,利用sc-PDB数据库得到蛋白靶点的5类共晶结构。采用vina程序,基于建立的小分子数据库,分别对5类共晶结构进行对接计算。通过重对接过程,计算rmsd(
【基金项目】
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工业发酵微生物重庆市重点实验室开放基金:酪氨酸蛋白激酶抑制剂的定量构效关系及虚拟筛选研究(LIFM201710);重庆科技学院研究生科技创新项目:NASH药物PPAR双重激动剂的虚拟筛选及分子设计(YKJCX1720512)
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通过虚拟筛选分子对接技术,利用sc-PDB数据库得到蛋白靶点的5类共晶结构。采用vina程序,基于建立的小分子数据库,分别对5类共晶结构进行对接计算。通过重对接过程,计算rmsd(均方根偏差值)来评估利用vina程序是否适用于该体系,通过构建诱饵化合物以及小分子与蛋白的相互作用分析来验证了模型的可靠程度。最终,利用该模型分别对5个靶点进行虚拟筛选,得到了效果较为理想的7个动剂分子,分析了分子和靶点蛋白的作用模式。
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