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会宁县鼠疫自然疫源地属甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地的一部分。1962年7月30日在会宁县刘寨乡东河村黑窑洞发生第一例肺鼠疫病例;1963年从主要宿主阿拉善黄鼠体内分离到鼠疫菌至今全疫区共剖检113886只,检菌4株,判定疫点3处。蚤类中共分离鼠疫菌4株,其中方形黄鼠蚤3株,阿巴盖蚤1株。为及时掌握疫情动态,针对性开展鼠疫监测工作。