【摘 要】
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为了解鸡GATA (ChGATA)家族基因特性,利用生物信息学方法对ChGATA基因家族成员进行鉴定,分析其理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、进化关系、蛋白质结构及蛋白质互作关系.结果 表明,共鉴定出6个ChGATA基因,不均匀地分布在5条染色体上.根据蛋白质保守结构域命名为ChGATA2-ChGATA6和ChTRPS1.理化性质分析结果显示,ChGATA均为无稳定的亲水蛋白质,且除ChTRPS1外均为碱性蛋白质.二级结构预测分析结果显示,ChGATA主要由无规则卷曲组成.保守结构域分析结果显示,
【机 构】
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河北科技师范学院河北省特色动物种质资源挖掘与创新重点实验室,河北秦皇岛066004
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为了解鸡GATA (ChGATA)家族基因特性,利用生物信息学方法对ChGATA基因家族成员进行鉴定,分析其理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、进化关系、蛋白质结构及蛋白质互作关系.结果 表明,共鉴定出6个ChGATA基因,不均匀地分布在5条染色体上.根据蛋白质保守结构域命名为ChGATA2-ChGATA6和ChTRPS1.理化性质分析结果显示,ChGATA均为无稳定的亲水蛋白质,且除ChTRPS1外均为碱性蛋白质.二级结构预测分析结果显示,ChGATA主要由无规则卷曲组成.保守结构域分析结果显示,ChGATA均包含ZnF_GATA结构域.系统进化分析结果显示,ChGATA基因家族可分为3个亚群,且同一亚群的基因结构相似、蛋白质三级结构相似、相互作用蛋白质较一致、亲缘关系较近.
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