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区域创新是区域竞争力的源泉,其能力高低直接决定了地区发展的效益和潜力。云南省区域创新能力一直较低,近几年在全国的排名虽有很大提高,但通过对2009年云南省区域创新能力各指标的分析可知,科研经费投入不足、区域产业层次低、外资企业比重偏低及产、学、研联系不紧密等仍是制约云南区域创新能力提高的重要因素。在此基础上结合云南省实际提出了相应的对策措施,以期为云南省制定下一步区域发展政策提供有益参考。