【摘 要】
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目的:研究皮肤黑色素瘤的免疫细胞浸润模式,以及免疫细胞浸润与患者预后的关系.方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载皮肤黑色素瘤转录本数据及相关临床数据,使用Cibersort软件的反卷积法计算22种免疫细胞的占比,采用R编程语言计算免疫细胞占比与性别的相关性,采用K-M生存分析log-rank法计算每种免疫细胞占比与总生存期(overall survival,OS)的相关性.结果:从TCGA数据库中得到472例基因转录本数据,包含黑色素瘤组织470例,
【机 构】
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重庆医科大学附属第二医院肿瘤科,重庆400010;重庆市第九人民医院肿瘤血液科,重庆400799
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目的:研究皮肤黑色素瘤的免疫细胞浸润模式,以及免疫细胞浸润与患者预后的关系.方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载皮肤黑色素瘤转录本数据及相关临床数据,使用Cibersort软件的反卷积法计算22种免疫细胞的占比,采用R编程语言计算免疫细胞占比与性别的相关性,采用K-M生存分析log-rank法计算每种免疫细胞占比与总生存期(overall survival,OS)的相关性.结果:从TCGA数据库中得到472例基因转录本数据,包含黑色素瘤组织470例,正常皮肤组织2例.每个样本检测基因位点60 483个,提取mRNA 19 658个.数据校正后使用Cibersort软件的反卷积法得到22种免疫细胞的占比数据,采用P＜0.05筛选样本,得到黑色素瘤组织219例,正常组织1例.M0巨噬细胞、CD8+T细胞、M2巨噬细胞在黑色素瘤中浸润水平较高;CD8+T细胞与M0巨噬细胞(-0.62)、未活化的记忆性CD4+T细胞与CD8+T细胞(-0.53)的占比相关性较强;K-M生存分析显示未活化的肥大细胞(P=0.015)、未活化的NK细胞(P=0.025)组成比例高者患者预后差,γδT细胞(P=0.043)组成比例高者预后更好.女性黑色素瘤患者中未活化的肥大细胞占比较男性黑色素瘤患者少(P=0.028).结论:皮肤黑色素瘤中浸润的免疫细胞组成存在差异,浸润的免疫细胞可能是决定预后的重要因素.这有助于开发有效的免疫疗法.
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目的:探讨环状RNA hsa_circ_0066336(circFLNB)在骨髓源性细胞中的表达,并分析其潜在功能.方法:选择骨髓源性细胞THP-1和Jurket作为模式细胞,通过设计背对背引物获得circRNA,分析circRNA在2种模式细胞中表达的差异.采用T-A克隆手段构建质粒,进行测序、比对.用Arraystar软件预测hsa_circ_0066336的靶标miRNA.从THP-1细胞中提取靶标miRNA后反转录,再以Real-time PCR检测.结果:①在THP-1和Jurket细胞中成功扩
在缺血性中风的发病机制中,由于内皮细胞等血脑屏障结构破坏、再灌注损伤、溶栓药治疗后凝血功能障碍等,恢复的血流从破坏的血管进入脑组织中,称为出血转化(haemorrhagic transformation,HT).严重的HT是导致患者死亡的原因之一.研究发现多种因素可能与HT有关,如高龄、糖尿病、患者病情严重等.能否由生物学标记物定量确定HT概率,并通过管理减少HT,将为临床HT的防治提供帮助.为此,本文就该方面的研究进展进行综述.
双重任务训练能有效改善脑卒中患者的运动和平衡功能[1],促进患者更好地参与社区生活[2].现报道1例脑出血患者在9周双重任务训练过程中,各个功能结局指标进展与皮质脊髓束神经结构的变化.rn1病例介绍rn患者,男,63岁,于2019年2月27日首次发病.诊断“脑出血,左侧基底节区”.病情稳定后,于2019年4月29日转至昆明医科大学第二附属医院康复医学部住院部进行康复训练.患者及家属同意参加实验并签署知情同意书.总计进行4次弥散张量成像扫描,分别为治疗前、治疗3周、治疗6周、治疗9周.每次均使用量表评估,并
脑出血发生数小时至数天内,由红细胞裂解产物引起的氧化反应、炎症反应及线粒体功能障碍将导致继发性脑损伤.过氧化物酶增殖物激活受体-γ(peroxisome proliferator-activated receptor-gamma,PPAR-γ)在内源性血肿清除系统中发挥多重作用,激活PPAR-γ后不仅在抗炎抗氧化方面发挥作用,还在介导吞噬细胞清除血肿方面发挥作用,因此激活PPAR-γ可能是治疗脑出血后继发性脑损伤的一个潜在靶点.
目的:通过转录组测序数据的分析,寻找与阿尔茨海默病(Alzheimer\'s disease,AD)发病有关的关键功能基因.方法:从GEO数据库下载GSE125050 RNA测序数据,对数据进行质控和过滤后使用edgeR进行基因差异表达分析,使用Matescape数据库对差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行GO和KEGG富集分析;使用clusterProfiler对生物学意义显著的分组进行基因集富集分析(GSEA);使用STRING数据库对神经元的
甲状腺相关眼病(thyroid-associated ophthalmopathy,TAO)是一种自身免疫性疾病,大多数患者同时伴随甲状腺功能异常的症状,具体发病机制还不清楚.目前普遍认为TAO与Graves\'病相关,是抗甲状腺的抗体与眼部自身抗原发生的交叉反应.TAO主要影响眼外肌、眼眶脂肪组织和眼眶内结缔组织,表现为眼眶糖胺聚糖聚集、眼眶纤维化、脂肪组织增生及眼眶组织重塑、眼球外突.多种因素都可以导致TAO发生,包括遗传因素、免疫因素及其他因素.本文主要对TAO发病免疫相关机制及影响因素作一综述
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