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【目的】应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption-ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术寻找染矽尘大鼠血清潜在生物标志物,探索建立染矽尘大鼠血清蛋白指纹分类决策树。【方法】128只雄性Wistar大鼠随机分为对照组和染矽尘模型组,以气管暴露法建立矽肺模型,分别在7、14、28和60 d进行腹主动脉采血。采用SELDI-TOF-MS技术以CM10芯片检测大鼠的血清蛋白指纹图谱,用Ciphergen公司专有软件分析数据并建立血清蛋白指纹分类诊断决策树。【结果】与对照组相比,14 d时,m/z 4968.66多肽分子在染矽尘大鼠模型组显著升高(P<0.05);而m/z 9312.29和m/z 9511.19多肽分子分别在28、60 d时显著升高(P<0.05),并均与Ⅰ型胶原增加呈显著正相关(r=0.982,P=0.018;r=0.939,P=0.061);以28、60 d的对照组和染矽尘大鼠组为训练样本,血清蛋白指纹诊断决策树图分类敏感性和特异性分别达100%、83.33%。【结论】m/z 4 968.66多肽分子可作为矽尘所致早期炎症反应的生物标记物,m/z 9312.29、m/z 9511.19多肽分子可能是矽尘所致进行性肺间质纤维化的标志分子。在矽尘暴露28、60d时,血清蛋白指纹分类诊断树的敏感性和特异性分别达100%、83.33%。