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完整藻胆体的室温荧光峰位于678nm附近，而不完整藻胆体其峰位于673nm以下。在液氮温度下，完整藻胆体的F686与F666相对荧光强度比值超过10，F686与F655之比值超过20。不完整藻胆体的F686与F666和F686与F655之比值远低于完整藻胆体。可用室温荧光峰的波长位置和液氮温度下F686与F655和F666的相对荧光强度比值来判断藻胆体的完整性和解离程度。而液氮温度下F686与F655，F666之比值是更灵敏的指标。