【摘 要】
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[目的]研究骨形态发生蛋白受体Ⅱ(bone morphogenetic protein receptorⅡ,BM PRⅡ)基因多态性及其单倍型与藏羊产羔性状的相关性.[方法]以433只藏羊母羊为研究对象,采用改良多重高温连接酶检测反应技术(improved multiple ligase detection reaction,iMLDR)对BMPRⅡ基因9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点在藏羊群体中的多态性进行检测,使用Haploview 4.2
【机 构】
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青海大学农牧学院,西宁810016
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[目的]研究骨形态发生蛋白受体Ⅱ(bone morphogenetic protein receptorⅡ,BM PRⅡ)基因多态性及其单倍型与藏羊产羔性状的相关性.[方法]以433只藏羊母羊为研究对象,采用改良多重高温连接酶检测反应技术(improved multiple ligase detection reaction,iMLDR)对BMPRⅡ基因9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点在藏羊群体中的多态性进行检测,使用Haploview 4.2软件分析其连锁不平衡性并构建单倍型,应用基因关联分析探究BMPRⅡ基因多态性及单倍型与藏羊产羔性状的关联.[结果]藏羊BMPRⅡ基因外显子12中存在6个SNPs,分别为:g.90192 T＞C、g.142532 C＞T、g.142614 A＞G、g.142751T＞C、g.143138 A＞G和g.143189 G＞A,外显子3、9和13中各存在1个SNP,分别为:g.143570 C＞G、g.124843 A＞C和g.145233 A＞G,这9个SNPs均为同义突变.9个SNPs中,除g.90192 T＞C外,均存在3种基因型.多态信息含量分析显示,群体在g.90192 T＞C、g.142614 A＞G和g.145233 A＞G位点处于低度多态(PIC＜0.25),在g.124843 A＞C、g.142532 C＞T、g.142751T＞C、g.143138 A＞G、g.143189 G＞A和g.143570 C＞G位点均处于中度多态(0.25＜ PIC＜0.5).x2适合性检验结果显示,所有突变位点均未偏离哈代-温伯格平衡状态.相关性分析显示,不同位点不同基因型与藏羊产羔性状均无显著相关(P＞0.05),但g.142532 C＞T位点CT基因型平均产羔数高于CC和TT基因型,g.142751T＞C位点CC基因型平均产羔数高于TT和TC基因型,g.143189 G＞A位点GA基因型平均产羔数高于GG和AA基因型,g.143570 C＞G位点CG基因型平均产羔数高于CC和GG基因型,g.145233 A＞G位点GG基因型平均产羔数高于AA和AG基因型,差异均不显著(P＞0.05).BMPRⅡ基因中除g.90192 T＞C位点外的8个SNPs位点在藏羊群体中共形成14种单倍型(H1～H14),单倍型与藏羊产羔数间均无显著相关(P＞0.05).[结论]BMPRⅡ基因g.142532 C＞T、g.142751T＞C、g.143189 G＞A、g.143570 C＞G和g.145233 A＞G位点对藏羊产羔数有一定潜在的影响.
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