研究目标:测度我国2007~2016年省域创新效率,分析各省域、三大地区和八大经济区域的创新效率的动态趋势和变化以及其时空收敛性质,探究R&D投入与创新效率之间的关系。研究方法:基于专利产出为创新产出的视角,运用DEA、SFA以及Bootstrap-DEA的面板模型测度区域创新效率,并采用σ收敛模型检验其时空的收敛性质。研究发现:传统的DEA模型存在明显的高估偏误,未加入环境因素的SFA模型参数偏误较大,Bootstrap-DEA测出的创新效率值具有更小的偏误;R&D投入与创新效率之间存在一定程度的正相关关系,但这种正相关关系在R&D投入达到一定数值时,有边际递减的倾向;2007~2016年全国平均创新效率呈现“U”形过程,东部沿海地区的创新效率遥遥领先,但地区与经济区域之间存在“追赶效应”;全国的创新效率收敛指数基本呈现“L”形过程,省域创新的效率差距在逐渐缩小,区域创新活动有一定的空间集聚现象。研究创新:首次运用Bootstrap-DEA的面板模型测度省域创新效率,对效率估计值的偏差进行修正,并给出其置信区间和模型偏误。研究价值:为各省域、各经济区域的创新效率的提高提供政策依据。