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机载双基地雷达杂波的距离依赖性降低空时自适应处理（STAP）杂波抑制能力，频率非均匀采样配准（RB—NFS）技术通过数据域信号处理可缓解杂波的距离依赖性。对该技术在机载双基地杂波抑制中面临的问题进行深入分析并给出改进方法，针对频率非均匀采样配准中杂波空时导向矩阵构造复杂，且存在杂波抑制不充分现象，提出引入广义逆矩阵或采用对角加栽技术解决问题的两种方案；针对频率非均匀采样配准采用最大似然准则估计杂波协方差矩阵，精度受STAP训练样本数影响的问题，给出新的协方差计算公式。仿真验证了分析的正确性和改进方法的有效