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利用变异系数法测量经济差异程度,对产业结构和贡献度差异角度进行深入分析把握经济差异度,表明福厦区域二三产业贡献度高;基尼系数法计算总基尼系数和分产业基尼系数、分产业贡献度、结构效应、地理集中效应及综合效应等,表明试验区区域差异扩大,三产业对区域不均衡发展的影响增加,其地理集中度效应大强化了区域经济差异。准确把握入区前三个区域经济差异根源,缩小三区经济发展差距,构建自贸试验区建区后的产业协同发展战略。