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从河南省某免疫蛋鸡群发病鸡分离到一株传染性支气管炎病毒,将其命名为HN/HL株。根据已发表的鸡传染性支气管炎病毒(IBV)核苷酸全序列,设计两对引物,一对引物用于鉴定感染IBV的阳性尿囊液;另一对引物用于扩增阳性尿囊液中IBV的S1全基因序列,并对其进行克隆测序。结果同GenBank上发表的S1基因序列相比较,分析表明此次分离的HN/HL株与国内不同地区(黑龙江,吉林等)流行的肾病变型IBV各株之间有较高的同源性(94%以上),其中与JS分离株(FJ345378)同源性最高,为98.9%;而与其他呼吸型IBV分离株及国际标准疫苗株的同源性较低(约75%左右)。对IBV S1基因推导的氨基酸序列进行分析,发现HN/HL株S1基因编码的氨基酸与其他IBV毒株的氨基酸同源性在72.2%~98.7%之间,其中与JS分离株(FJ345378)同源性为98.9%,与山东呼吸型分离株(AF208240)同源性为76.2%。对S1基因的氨基酸序列进一步分析发现,HN/HL株、SD株(FJ345384)等毒株主要为肾型IBV,S蛋白切割识别位点序列主要为H—R—R—R—R;疫苗株H120和H52等毒株为呼吸型IBV,S蛋白切割识别位点序列均为R—R—F—R—R;而US株肾型IBV S蛋白切割识别位点序列为R—R—S—R—R。基因进化树分析表明HN/HL株同国内大多数肾型分离株在同一个分支上。