玉米自交系线粒体基因组序列变异分析

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在高等植物中,细胞器基因组包括叶绿体基因组和线粒体基因组。目前研究发现高等植物线粒体基因组是所有生物中最大、最复杂的。玉米较小麦和水稻线粒体基因组较大,但物种间基本的功能基因数目变化不大,基因组复杂性相对保守。通过对已经发表的三个玉米细胞质雄性不育系(CMS-C,CMS-S,CMS-T)和可育自交系(NA,NB)的33个已知功能的编码基因进行比对分析,发现10个基因序列发生了变异,引起蛋白质序列发生变异的基因共8个(分别是rps3,nad2,atp4,ccmFN,nad7,rps13,rps2A和rps2B),其中变异最大的是atp4基因,存在11个SNP,1个Indel,7氨基酸变异位点。将atp4基因和rps13基因在5个玉米自交系中扩增并测序,序列分析比对结果如下:(1)atp4基因在5个玉米自交系中共检测到26个SNP和6个Indel,引起蛋白质序列发生变异的位点22个;(2)rps13基因在5个玉米自交系中共检测到11个SNP,无Indel,引起蛋白质序列发生变异的位点8个。
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