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外科感染常见病原菌革兰阴性杆菌占60％-65％;革兰阳性球菌占30％-35％;其余是真菌.不同种类的外科感染,病原菌构成有所不同.细菌对抗生素的耐药性在不同地区、不同医院可有较大差异。外科医生在选择药物时，应主要参考本地区、本医院的监测结果。急性外科感染的抗菌治疗一般都是在尚未获得细菌培养和药物敏感试验结果的情况下开始，属经验性用药，即根据感染的部位、性质，估计是哪一类细菌引起，以及该类细菌可能对哪些抗生素敏感的基础上，选择恰当药物并参考药效动力学，药代动力学参数，合理制订用药方案。一旦获得细菌培养及药物敏感试验结果，就要重新审视原有用药方案，进行目标(针对性)治疗。同时感染是最常见的手术后并发症，正确预防性应用抗生素有助于减少SSI。