Genome-wide association study of thermaltolerance in large yellow croakerLarimichthys crocea based o

来源 :2015年福建省水产学会学术年会暨省科协第十五届学术年会卫星会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lianxingjiehaha
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  Temperature is one of the most important ecological factors that significantly affects the growth, metabolism, development and other life activities in larger yellow croaker.With rising global temperatures, it is necessary to expedite basic research on how temperature impacts the growth and development of L.crocea.A genomewide association study was performed using specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-seq) technology in thermaltolerance and thermal sensitive group.Finally, 38 single SNPs (P<2.39E-08) that associated with thermaltolerancewere detected using General Line Model (GLM).Genes in the candidate regions with 1 Mb windows (SNP position ± 0.5Mb) surrounding each significant SNP were screened and 28 candidate genes were obtained.These results provide basic information to develop thermaltolerance lines of L.crocea using marker-assisted selection breeding in the future.
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