基于分子对接和topomer CoMFA的c-met抑制剂研究

来源 :中国药理学会抗炎免疫药理专业委员会成立30周年纪念大会暨2012年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhusimeng
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  目的:通过分子模拟技术研究氮杂芳环系列化合物与c-met的相互作用,并据此进行化合物的修饰。方法:运用分子对接技术研究了70个作为c-met抑制剂的N杂环化合物与受体的相互作用模式,分析相互作用强弱与活性的关系。基于分子对接结果对化合物进行R基团的拆分,并据此建立Topomer CoMFA模型,进而进行氮杂环化合物的改造。结果:分子对接结果表明,两种U型折叠模式主要取决于pi-pi堆积作用的强弱和柔性连接基团的匹配好坏。铰链区的氢键作用和与Tyr1230的pi-pi堆积作用对活性起重要作用。Topomer CoMFA的结果表明pi-pi堆积作用对活性的贡献较大,缺电子杂环基团有利于pi-pi堆积作用。结论:与铰链区的氢键作用、连接基团的疏水性和芳香杂环的堆积作用对活性具有重要贡献,其中pi-pi堆积作用的贡献最大。在这三个区域进行分子设计可提高化合物对c-met的抑制活性。
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