【摘 要】
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目的 分析放射性肺损伤大鼠的差异表达基因,从转录组水平揭示亚低温对大鼠放射性肺损伤的防护机制.方法 本研究随机选取10 只6-8 周龄雄性SD 大鼠建立放射性肺损伤大鼠模型,并对其中5 只进行亚低温干预,分别提取各组大鼠左侧肺组织,用BGISEQ-500 平台进行测序.采用edgeR 软件进行基因表达差异显著性分析.分析模型组与亚低温治疗组基因表达的变化,然后对差异表达基因进行GO 功能富集分析和
【机 构】
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中国辐射防护研究院药物安全性评价中心,药物毒理与放射损伤药物山西省重点实验室,中核放射毒理与放射性药物临床前评价重点实验室,太原 030006
【出 处】
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中国环境诱变剂学会风险评价专业委员会第二十届全国学术交流会议
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目的 分析放射性肺损伤大鼠的差异表达基因,从转录组水平揭示亚低温对大鼠放射性肺损伤的防护机制.方法 本研究随机选取10 只6-8 周龄雄性SD 大鼠建立放射性肺损伤大鼠模型,并对其中5 只进行亚低温干预,分别提取各组大鼠左侧肺组织,用BGISEQ-500 平台进行测序.采用edgeR 软件进行基因表达差异显著性分析.分析模型组与亚低温治疗组基因表达的变化,然后对差异表达基因进行GO 功能富集分析和KEGG 通路富集分析,并采用qRT-PCR 技术对其中5 个关键差异表达基因进行验证.结果 亚低温治疗组与模型组比较有2790 个差异基因(FDR＜0.001,|logFC|＞1),其中2257个基因上调,533 个基因下调.5 个关键基因qRT-PCR 验证结果与RNA-Seq 趋势一致.GO 功能富集分析结果表明,这些差异表达基因与细胞结合、代谢过程及细胞膜结构等有关；KEGG 通路富集分析结果表明,这些基因参与CAMs、mTOR、Tight junction 及NF-κB等重要生物学通路.结论 得到亚低温防护大鼠放射性肺损伤相关差异表达基因及作用通路,为利用模型大鼠进行亚低温相关机制和治疗研究提供了实验依据.
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