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建立了online trapping-cHILIC-ESI-MS/MS全基因组DNA甲基化分析的高灵敏定量分析方法,对5-mC和5-hmC的检测限(LOD)分别达到0.06fmol与0.19fmol。通过对148个肝癌组织以及癌旁组织的分析,发现5-hmC在肝癌组织中有4-5倍的降低,并和癌症的不同分期有显著相关性;通过利用糖基化标记法并结合质谱分析,建立了SPE-HPLC-MS/MS方法用来检测哺乳动物和酵母细胞全基因组5-hmC相比直接将DNA酶解液进HPLC-MS/M分析,灵敏度有50倍提高。利用该方法在酵母中发现5-mC和5-hmC,并且5-mC和细胞的不同生长状态密切相关;建立了基于超高交联整体柱的全基因组5-mC的nanoLC分析方法,其检测限(LOD)比常规的HPLC-UV方法要低500倍。