【摘 要】
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采用5FullRACE技术及RT=PCR方法,分段设计引物,成功扩增出包含猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株HB-2(sh)/2002全基因组的所有cDNA片段,分别克隆到pGEM-TEasy质粒载体,经序列测定
【出 处】
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中国微生物学会兽医微生物专委会学术年会中国畜牧兽医学会生物制品学分会第九次学术研讨会
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采用5FullRACE技术及RT=PCR方法,分段设计引物,成功扩增出包含猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株HB-2(sh)/2002全基因组的所有cDNA片段,分别克隆到pGEM-TEasy质粒载体,经序列测定和拼接获得该分离毒株的全基因组序列.结果表明,该毒株的全基因组长度为15373nt(不包括PolyA尾),由9个开放阅读框(ORFs)组成,其中2个编码非结构蛋白,蓁其余7个编码结构蛋白.序列比较显示HB-2(sh)/2002与国内外各美洲型分离株全序列相~95.1％之间,与欧洲型LV株的全序列相似性为54.3％.依据Nsp2的系统进化分析表明HB-2(sh)/2002与HB-1(sh)/2002及CH-1a遗传距离较近,属于2个亚群.序列分析发现HB-2(sh)/2002的Nsp2存在编码12个氨基酸的连续36个核苷酸的缺失,结构蛋白GP3存在编码1个氨基酸的连续3个核苷酸的缺失,由此表明该毒株为一个天然存在缺失的变异毒株.本项研究结果补充和丰富了我国PRRSV毒株的基因组信息数据,为深入研究该毒株的生物学特性、遗传与变奠定了基础.
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