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本研究的目的是建立猪内源性反转录病毒(porcine endogenousretrovirus,PERV)在基因组中整合拷贝数的检测方法。设计并合成了检测PERV pol基因的引物,采用基于SYBR Green I的实时荧光定量PcR方法,检测小型猪基因组DNA中多聚酶基因(pol)的拷贝数,估算出单细胞基因组中PERV整合的拷贝数,从而建立起PERV整合拷贝数的检测方法,并对该方法进行特异性、敏感性、重复性分析。结果表明,该检测方法特异性较高,敏感性高于普通PCR方法。五指山猪与巴马小型猪基因组中均可检测到pol基因的存在,五指山猪单细胞基因组中PERV的拷贝数为1.38±0.33至14.23±3.31之间,巴马小型猪单细胞基因组中PERV的拷贝数为2.96±0.76至58.46±3.50之间。统计学分析表明五指山猪与巴马小型猪单细胞基因组中PERV的拷贝数具有显著性差异,五指山猪基因组中整合的PERV拷贝数较低。五指山猪基因组中PERV的基因序列负荷较低,因此有希望通过选择性育种获得PERV低拷贝猪,在此基础上则易于进一步筛选出无完整PERV前病毒的小型猪个体,也易于通过基因敲除去除PERV,从而为异种移植提供合适供体。此外,基于SYBRGreen Ⅰ的PERV拷贝数的定量PcR检测方法,简便易行,可在短时间内检测大量样品,费用低廉,利于对猪群进行大规模筛选,既可用于实验用猪的病原安全性评价,也可用于异种移植后PERV存在与表达状况的监测。