【摘 要】
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本文描述了一个被名为MORT(Molecular Objects and Relevant Templates)的函数库,它能够作为计算生物学和计算机辅助药物设计(CADD)相关软件的开发基础.MORT和其他的一些
【机 构】
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苏州大学功能纳米与软物质研究院,江苏省苏州市仁爱路199号,215123
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本文描述了一个被名为MORT(Molecular Objects and Relevant Templates)的函数库,它能够作为计算生物学和计算机辅助药物设计(CADD)相关软件的开发基础.MORT和其他的一些库比较具有以下几个优势：1.MORT使用C++编写,充分利用了C++的面向对象的思想,使其易于理解和并具有良好的可拓展性.2.在表征分子时,MORT采用了关系模型,相对那些使用层次模型的库来说具有更大的灵活性.3.MORT中包含了大量的功能函数,这意味着它能对一个分子进行各种处理.例如,MORT可以解析各种不同格式的分子文件(MOL/SDF、MOL2、PDB/ENT、SMILES/SMARTS等等)；能够生成AMBER支持的拓扑文件和坐标文件；能够基于AMBER力场来计算特定分子的能量等等.对于计算生物学和CADD的程序开发者来说,以MORT作为基础功能库将给他们带来极大的便利.
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