以出露化石为主要证据,结合花粉形态和染色体数目的资料,可以推论：蔷薇科植物的进化顺序可能为绣线菊亚科、蔷薇亚科、苹果亚科、李亚科。绣线菊亚科的化石最早出现在东北,由此往南扩散,出现了蔷薇亚科,再往南,才有苹果亚科。苹果亚科首先出现在黄河中游的甘肃和陕南,花楸属可能足苹果亚科的进化中枢,它可能足枇杷的先祖。 及至中新世,在黄河下游的河北和山东出现包括枇杷属在内的苹果亚科的大爆发。但到了上新世气候变得干凉,枇杷将退到扬了江流域的亚热带地区生长,黄河流域不再有枇杷属植物。 枇杷可能从原始产区的两部(黄河中游)迁入秦岭南部至横断山脉一带,在那里形成现代种群的一些代表种,包括普通枇杷,可能还有香花枇杷、椭圆枇杷、大渡河枇杷等。这些种类的一部分在喜马拉雅山降起还不到1000米的时候,就有香花枇杷和椭圆枇杷等,往两扩散到中国的西藏、尼泊尔和印度等。另一方面,一些枇杷种类进一步往南扩散,在云南两部的“三江并流”处,形成向东南的金沙江和向正南的怒江及澜沧江(湄公河)两个方向,向东南的普通枇杷和由香花枇杷演变来的大花枇杷等沿金沙江进入扬子江,沿扬子江入东海,普通枇杷还远涉日本。而向正南的方向上,在高黎贡山一带又可能衍生出怒江枇杷和腾越枇杷。这些枇杷进入缅甸,又演化出其它一些种类。枇杷属植物第二次较大规模的进化则是在滇中和滇东南一带。进化出大花枇杷、窄叶枇杷、麻栗坡枇杷等多达10多种的枇杷,并向三个方向扩散,一个方向足澜沧江(湄公河)进入老挝,一个方向是沿元江(红河)进入越南,最后一个沿贵州和广西的边界进入广西,沿西江流域在广西和广东产生广西枇杷和台湾枇杷,最后台湾枇杷在台湾南部产生台湾枇杷恒春变型。