利用分子相关度估计中国对虾抗WSSV性状的遗传参数

来源 :中国水产科学研究院黄海水产研究所第十二届研究生学术交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:siquan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  中国对虾是中国重要的养殖品种,然而利用系谱估计中国对虾的遗传参数有不足之处,本实验的目的就是评价利用分子相关度的方法估计中国对虾抗WSSV性状的遗传参数的可行性.实验包含2015年的31个家系(包括4个半同胞家系,27个全同胞家系)和2016年的36个家系(包括15个半同胞家系,21个全同胞家系),共670个样品.对所有家系进行抗WSSV测试,记录每个个体的存活时间.利用15对不连锁的微卫星标记分别进行基因分型,计算分子相关度.根据相同的动物模型和限制性最大似然法,利用分子相关度和系谱相关度分别估计中国对虾抗WSSV性状的遗传力和育种值,然后利用交叉验证检验估计值的准确性.分子相关度和系谱的皮尔逊相关度为F,利用分子相关度和系谱估计的遗传力分别为A和B,交叉验证结果显示物理系谱和分子相关度估计育种值的准确度分别为C和D.最后结果表明利用分子相关度估计中国对虾的遗传参数是一种有效的方法.
其他文献
牙鲆(Paralichthys olivaceus)养殖病害日益严重,迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)是牙鲆养殖中的主要致病菌,带来了极大的经济损失,为了培育出对该病抵抗能力强的牙鲆新品种,本研究以历年培育的抗病、速生牙鲆为亲本于2016年建立了29个家系,包括4个F3代、23个F4代家系和1个对照家系.在170日龄进行迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)感
以前期构建的产α-环糊精葡萄糖基转移酶的菌株Y112为研究对象,进行了19L发酵罐工艺条件优化以及中试放大实验的研究。考察了发酵罐接种量、转速、温度、pH、溶氧和发酵时间对α-环糊精葡萄糖基转移酶的发酵过程的影响。优化了发酵条件:接种量6%、转速300r/min、温度27℃、自然pH、溶氧30%-40%,发酵36h时,α-环糊精葡萄糖基转移酶发酵活性达2870U/mL,比初始发酵活性提高了32%。
水通道蛋白1 (AQPl)是具有特殊结构特征的跨膜水通道蛋白的一员.在本研究中,利用RACE技术克隆得到AQP1基因的全长,并对其进行相关分析.AQP1序列全长为1411bp,其中ORF为786 bp,编码261个氨基酸.生物信息学分析显示该蛋白具有6个跨膜α螺旋结构域和两个高度保守的天冬酰胺-脯氨酸-丙氨酸(NPA)基序.实时定量PCR显示,AQP1在雄鱼和伪雄鱼的精巢中表达量最高,在其他组织中
近年来,东南亚对虾养殖场已报道了越来越多的对虾生长缓慢的现象,这些养殖场的对虾严重地感染了虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)。为寻找EHP影响对虾生长的相关证据,对采集自河北、山东和上海等地的凡纳滨对虾群体进行了对虾肝胰腺EHP载量的Taqman探针实时荧光定量检测及对虾的生物学体长、体重的测量。对山东日照的一批凡纳滨对虾进行了肝胰腺、肠道、鳃、肌肉、血淋
眼点淀粉卵涡鞭虫渤海株是斑石鲷育苗期的主要寄生虫病原.为了确定该病原的系统分类地位,本研究设计了两对特异性引物,利用PCR方法扩增出了病原的两个DNA片段,克隆到pEASY-T5载体中.测序后拼接得到长度为4737 bp的眼点淀粉卵涡鞭虫渤海株rRNA基因序列.通过Blast比对发现,该序列由573 bp的部分小亚基rDNA、352 bp的内转录间隔区1、159 bp的5.8 S rDNA、692
本实验分别对中国明对虾野生群体(Wild-Fenneropenaeus chinensis,W-Fc)、中国明对虾选育群体“黄海2号”(Selected-Fennero -penaeus chinensis,S-Fc)和凡纳滨对虾商业一代苗种(Commercial-Litopenaeus vannamei,C-Lv)三组对虾采用单尾定量口饲感染(白斑综合征病毒)WSSV的方法进行感染实验,比较W-
本研究对100个凡纳滨对虾幼虾家系(日龄12-31d)进行了淡化试验和低盐养殖试验,比较了两个阶段家系间存活率的差异性并估计了存活性状的遗传力.结果表明,两个阶段存活率范围分别为19.33-100.00%和11.9-99.2%,平均成活率分别为66.7%和67.5%.家系幼期总体成活率范围为6.67%-90.67%,平均成活率为46.91%.统计分析表明,两个阶段家系间存活率差异极显著(P<0.0
为探究近年来导致对虾发病的主要原因,发掘潜在的致病性病原,本文尝试对7批发病的养殖凡纳滨对虾样品进行病毒组学研究.Meta测序分析显示,得到的数据中有25-80%被注释为病毒,其中有疱疹病毒、虹彩病毒等潜在的致病性病原.对测序数据进行拼接验证,获得了一种虹彩病毒的大部分DNA序列.对保守基因MCP和ATPase的进化树分析显示,新病毒不属于虹彩病毒科下已知的任何一个属,拟定为凡纳滨对虾虹彩病毒(L
假交替单胞菌是一株分离自健康大菱鲆肠道,且能够提高对虾免疫力和抗病力的益生菌.本研究根据养殖环境条件优化其发酵对虾配合饲料的简易工艺条件,优化结果如下:接种量为2×108 cfu/g;料水比为1∶0.4;发酵时间为10 h;发酵温度为28℃,料糖比1∶0.1.发酵产物中菌浓度可提高到1-2个数量级,优化模型简易实用.为了探究假交替单胞菌发酵饲料饲喂凡纳滨对虾的效果,选用640尾初体重为(0.23±
本研究评估了大菱鲆耐氨氮性状和体长、体重的遗传力以及他们之间的遗传相关,为大菱鲆耐氨氮品系选育提供技术参考.实验采用人工授精技术,建立60个大菱鲆全同胞家系,其中选取建立时间相近的40个家系,在100日龄时进行荧光标记,混养一个月后开展氨氮毒性试验.应用数量遗传学原理,对所得结果的方差组分进行剖分.结果所得非离子氨对4月龄大菱鲆的72hLC50为1.80mg/L.4月龄大菱鲆耐氨氮性状遗传力为(0