比较不同样本前处理方法对高通量测序检测HBV,HCV,TTV结果的影响

来源 :中国生物工程学会2014年学术年会暨全国生物技术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huangqianqian
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  为了探索不同样品前处理方法对于不同类型病毒检测的效果,我们分别将携带乙肝(双链环状DNA病毒)、丙肝(单正链RNA病毒)、TTV(单链环状DNA病毒)这三种不同病毒的血清等比例混合,模拟混合感染,然后分别采用MDA扩增(多重置换扩增)和随机锚定PCR扩增并进行高通量测序,同时以原始样品(未扩增)直接高通量测序作为对照。测序结果显示,MDA扩增方法适合扩增环状病毒,随机锚定PCR扩增适合含量高的病毒,不作任何处理直接高通量测序检测病毒效果最差。本研究通过探索不同样品前处理方法,为指导不同类型病原体如何选择扩增方案提供借鉴。
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