已经鉴定的、能够感染杀虫的杀虫真菌涉及5 个门,达1000 从种,其中代表性的种类主要为广义虫草菌类的子囊菌门杀虫真菌。球孢白僵菌、蝗绿僵菌和罗伯茨绿僵菌等既是害虫生物防治应用的优势种类,也成为真菌—昆虫互作互作机理研究的模式物种。针对不同广义虫草菌类的杀虫真菌基因组及比较基因组研究表明,真菌的杀虫特性经过了多次进化,白僵菌及绿僵菌等杀虫真菌同植物内生真菌及植物病原真菌的亲缘关系较近；同植物病原真菌及人类病原真菌的比较分析表明,不同类别的病原真菌之间及内部既有趋异进化也有趋同进化；丝氨酸蛋白酶和几丁质酶扩张是杀虫真菌基因组的典型特征。对寄主范围不同的不同种类的绿僵菌进行基因组分析表明,绿僵菌由专性寄生菌,经过中间过渡类型向广谱杀虫的绿僵菌种类方向进化,伴随着不同蛋白家族的扩张,尤其是次级代谢基因家族的扩张,从而使广谱菌能够适应更多的寄主种类。结合RNA-seq 的数据转录组分析表明,GPCR 蛋白家族的数量、应答不同昆虫寄主的表达特征及其介导的下游信号途径,控制附着胞的分化与形成,从而决定了绿僵菌的寄主专化性。除冬虫夏草外,子囊菌类杀虫真菌的有性生殖方式为异宗配合,但同能够进行频繁有性生殖的蛹虫草等相比,在自然条件下营无性繁殖的白僵菌和绿僵菌种类的基因组结构存在很大区别。不同杀虫真菌基因组的完成为进一步开展致病相关的功能基因组及真菌—昆虫互作机理研究奠定了良好的基础。