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长期以来,很多人对于认知语言学和中医的科学性提出质疑,甚至称他们为伪科学,质疑的理由无非就是:一是虽然认知语言学和中医对于语言和生理病理的解释力较强,但无法证伪;二是不符合现代科学的逻辑实证主义精神,不能采取还原论的研究方法。从认识论哲学的视角来讲,认知语言学和中医学的哲学基础和研究方法有很多相同之处。通过对两者的哲学基础和研究方法进行比较,我们发现两者都有共同的体验哲学和经验主义的哲学基础,研究方法和还原论的方法不同,都采取整体论和系统论的方法,都注重从功能的角度开展研究,如认知语言学和中医目前都采用"黑箱法"的研究方法。两者不仅不是伪科学,而且都与人类的认知相关,两个学科的发展存在跨学科之处,认知语言学的研究成果也可以被用来解释中医的语言现象,利用认知语言学的某些理论可以对中医实践进行解释,这个跨学科地带值得学界进一步研究。