SNP芯片联合飞行时间质谱筛检胃癌差异miRNA自身SNPs的病例对照研究

来源 :中国环境诱变剂学会风险评价专业委员会第二十届全国学术交流会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:peng6265066
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  目的:本研究旨在探索与胃癌发生相关的新的miRNA 自身单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs),为寻找有价值的胃癌分子标志物提供新的依据.方法:本研究采用1:1 配对病例对照研究的方法.应用SNP 芯片对福建省胃癌高发区96 例胃腺癌患者与96 例健康对照人群基因组中miRNA 自身SNPs 位点进行检测,应用飞行时间质谱分析质谱技术对芯片筛检出来的miRNA 自身SNPs位点在622 例胃癌患者和622 例正常健康基因组中进行验证.结果:(1)SNP 芯片及生物信息学分析选取miR-379 rs7143252,miR-519brs10413288,miR-1297 rs9536676,miR-29c rs2724377,miR-7159 rs4713714为候选基因研究.(2)对大样本的病例对照组候选基因SNP 分型,rs7143252中含有G 等位基因的基因型(CG+GG)患胃癌的风险高于CC 基因型OR 1.92,95#CI 1.18~3.12,而其他位点则与患胃癌的风险无统计学意义.分层分析结果发现rs7143252 CG 基因型与贲门癌相关OR 2.11,95#CI 1.01~4.40,含有G 等位基因的基因型(CG+GG)患非贲门癌风险高于CC 基因型OR 2.13,95#CI 1.08~4.19,rs10413288 中含有G 等位基因的基因型(AG+GG)患贲门癌的风险低于AA 基因型OR 0.58,95#CI 0.36~0.94.结论:rs7143252,rs10413288 位点可能是胃癌患者的特异性生物标志物,与福建省胃癌高发区仙游县的胃癌发生发展有关.
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