【摘 要】
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水生动物与水环境关系密切,然而水生动物的共栖微生物与其所生活的水体中微生物的差异尚不明确.尽管大量研究已经揭示哺乳动物共生细菌形成的影响因素,但是解析水生生物
【机 构】
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水生动物营养与环境健康实验室,华东师范大学,上海,200241
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水生动物与水环境关系密切,然而水生动物的共栖微生物与其所生活的水体中微生物的差异尚不明确.尽管大量研究已经揭示哺乳动物共生细菌形成的影响因素,但是解析水生生物共生菌群影响因子的工作才刚刚起步.中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)是中国的经济养殖物种,了解中华绒螯蟹肠道及其它部位共生微生物的结构和影响因素对于该物种的养殖及健康调控非常重要.从阳澄湖、崇明岛以及江苏和上海的两个养殖池塘,共四个采样点采集野生或者饲养的中华绒螯蟹及其生活的水体.抽提水环境及中华绒螯蟹腮及肠道共生微生物的基因组DNA,采用16S rRNA基因高通量测序方法对各样本中微生物的组成进行分析.超过660 000条序列的分析结果显示水体中的细菌多样性高于腮和肠道中的.Tenericutes和Proteobacteria是中华绒螯蟹肠道中的主要成员,而Actinobacteria、Proteobacteria和Bacteroidetes则在腮和水体中较为优势.非线性多维标度(NMDS)分析表明来自于腮、肠或者水体的菌群被清楚的分为三个组,说明尽管中华绒螯蟹生活在水中,但它们仍旧会选择性的定植一个有别于水体的微生物群落.中华绒螯蟹肠道与腮上共栖的微生物组成差异说明和哺乳类相似中华绒螯蟹共生微生物的分布也具有器官特异性.而存在于沉积物或者海水的与Ilumatobacter和Albimonas相关的OTUs,仅在腮中检测到,在其所生活的水体中并未被检测,考虑中华绒螯蟹具有生殖洄游现象,我们推测这些微生物可能是在幼蟹阶段就被定植.这些结果提示中华绒螯蟹的生理行为也会影响其共栖微生物的组成,这也为后续中华绒螯蟹共生微生物结构的调控提供新的思路.
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