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文章根据几年来功能区划制度建立和完善的经历，阐述了其在海域使用管理中的重要地位；针对海域使用论证报告编制过程中遇到的几个问题，探讨了海洋功能区划制度在海域使用管理实施中的一些不足之处，内容涉及区划管理部门、编制部门及实施对象，主要包括：海洋功能区划的“符合性”、上下级功能区划“一致性”、功能区划编制差异和详尽程度及区划中有关围填海的问题；结合国外的一些研究思路、专家的意见以及个人的一些见解，就提出的问题给出了相关的建议。