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采用数据包络分析DEA方法与Malmquist生产率指数方法,从2006-2010年制造业整体行业的科技创新效率出发,对其中涉农制造行业的科技创新效率进行评价。通过截面数据对历年制造业涉农行业科技创新综合效率、规模效率、纯技术效率与行业整体情况进行对比分析;通过面板数据对制造业涉农行业科技创新进行全要素生产率分析。结果表明:与行业整体水平相比,我国制造业涉农行业科技创新的综合效率不高,纯技术效率水平较低,部分行业科技投入浪费现象较严重,但规模效率水平较好,涉农行业科技创新活动的全要素生产率呈不断增长的趋势。