【摘 要】
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海岛棉的EST-SSRs主要是通过传统的Sanger测序获得的序列而开发的.由于测序成本高以及所获得的序列较少,从中开发的EST-SSRs标记也比较少.近几年出现的高通量测序技术为
【机 构】
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华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,湖北 武汉 430000
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海岛棉的EST-SSRs主要是通过传统的Sanger测序获得的序列而开发的.由于测序成本高以及所获得的序列较少,从中开发的EST-SSRs标记也比较少.近几年出现的高通量测序技术为分子标记的开发提供了新的手段.本课题组构建了海岛棉3-79的发育纤维的非平衡化cDNA文库和海7124的根组织的平衡化文库,并进行了454高通量测序,分别获得了219.63 Mb和204.61Mb的数据.利用这两套数据,从中开发EST-SSRs.非平衡化的纤维文库包含662723个ESTs,平均长度为347 bp,从中获得了7255个SSRs,平均频率为1个每31.00 kb；根的平衡化文库包含579523个ESTs,平均长度为370 bp,从中获得了16087个SSRs,平均频率为1个每13.02 kb.
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