玉米大斑病菌水干油通道蛋白基因StFPs1的克隆及生物信息学分析

来源 :中国植物保护学会2014年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wajohn
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  玉米大斑病是目前玉米生产上的重要叶部病害,据报道,种植感病品种在流行年份减产可达50%.引起该病的病原菌为玉米大斑凸脐蠕孢菌(Ex.serohilum turcicum),有性态为大斑刚毛座腔菌(Setosphaeria turcica).研究发现,玉米大斑病菌至少存在三类信号转导途径,cAMP、Caz+和MAPK途径,这些信号途径与病菌的分生孢子产生、病菌侵入、附着胞形成及发育、细胞壁形态建成、胁迫反应等过程相关.本实验室在前期研究中,确定了玉米大斑病菌中存在着3条MAPK途径,其中,HOG-MAPK途径参与调控病菌的高渗胁迫反应,推测玉米大斑病菌水甘油通道蛋白基因位于HOG-MAPK途径的下游参与病菌的渗透胁迫反应.本研究拟基于JGI网站(http://genome.jgi-psf.org/)公布的玉米大斑病菌的基因组序列数据,以酿酒酵母的水甘油通道蛋白ScFPSI的氨基酸序列为探针,通过Blastp搜索玉米大斑病菌的FPSI类水甘油通道蛋白,并对其基因进行克隆和生物信息学分析.结果发现,玉米大斑病菌中蛋白序列ID为153061与ScFPSI之间具有HSP,相似性为57%;克隆得到了玉米大斑病菌水甘油通道蛋白基因StFpsl,该基因DNA全长为1 393bp,cDNA全长为1 179bp;该基因含有4个内含子,5个外显子,编码392个氨基酸,蛋白质序列具有6个典型的跨膜结构域,分子量为43.18kD,等电点为8.21,不稳定指数为46.77,为不稳定蛋白.本研究成功克隆了玉米大斑病菌水甘油通道蛋白基因StFpsl,并对其进行了初步的生物信息学分析,为从分子水平上深入了解玉米大斑病菌StFpsl基因功能奠定基础.
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